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ISMB/ECCB 2017読み会

日時 :
2017/08/27 (日) 10:00 ~ 18:00
定員 :
50人
会場 :
理化学研究所和光キャンパス 脳科学池の端研究棟 3階大会議室(埼玉県和光市広沢2-1)
URL :
http://www.riken.jp/access/wako-map/
主催者 :
ハッシュタグ :
#ismb2017yomi

概要

ISMB 2014読み会」 「ISMB/ECCB 2015読み会」 「ISMB 2016読み会」に引き続き、 本年度もISMB/ECCBの読み会を開催します。

ISMBは、生命情報学に関するアルゴリズムや数理モデルなど情報科学よりの研究を対象とした国際会議で、バイオインフォマティクス分野で最大かつ最難関のトップカンファレンスです。

ISMB/ECCBに採択された口頭発表のProceedingsはBioinformatics誌の特集号として出版されます。

「ISMB/ECCB読み会」は、バイオインフォマティクス分野最大の国際会議に採択された論文の概要をなるべく多く知ることによって、分野全体の流行を手っ取り早く把握することを目的としています。トップのレベルを感じることによって、どうすれば世界を相手に戦うことができるか、参加者全員で考える機会になることを期待します。

現在、発表者を募集しています。論文1本当たり15-20分程度で紹介していただく予定です。奮ってご参加ください。聴講だけのご参加ももちろん歓迎です。

発表希望の方へ

  1. 発表希望の方は必ず参加登録をお願いします
  2. 参加登録の後、読みたい論文をここから選んで下のコメント欄に書き込んでください。

    対象となる論文は、Bioinformatics 33(14):i5-i398の間の論文です。それ以外はISMB/ECCBとは関係ない論文ですので選択しないでください。

8/15にプログラムを確定しますので、それまでに申し込んでください。

発表の際には、以下のことに注意していただけると良いと思います。

  • 発表時間が限られていますので、可能な限り詳細は省き、エッセンスのみを発表するようにしてください。例えば、この論文のどこがすごいのか、なぜISMBに採択されたのか、などに絞って説明していただけるとわかりやすいです。
  • 詳細については、発表を聞いて興味をもった聴講者が自身で論文を読んでください、というスタンスで結構です。

聴講希望の方へ

もちろん歓迎です。参加登録をお願いします。もし万が一参加希望者が溢れた場合には、聴講のみの方にはご遠慮願うかもしれません。あしからずご了承ください。

会場へのご案内

  • 西門守衛所にて一時入構手続きを行う必要があります。手続きの際は 行き先:池之端研究棟 尾崎、目的:セミナーとしてください。
  • 理研へのアクセス、構内地図はこちらです。
  • 理研内のコンビニは日曜日は休みです。また、理研の近くにもコンビニがありませんのでご注意ください(和光市駅前にはあります)。自販機は会場近くにあります。

懇親会

18:00ぐらいから有志で懇親会を行う予定です。

世話人

佐藤健吾@慶大、齋藤裕@産総研、尾崎遼@理研、福永津嵩@早大

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stkng
stkng - (2017/07/13 (木) 09:41)
DeepBound: accurate identification of transcript boundaries via deep convolutional neural fields を読みます。佐藤@慶大
fukunagaTsu
fukunagaTsu - (2017/07/13 (木) 12:17)
Efficient approximations of RNA kinetics landscape using non-redundant samplingを読みます。福永@早大
gggtta
gggtta - (2017/07/13 (木) 12:46)
Image-based spatiotemporal causality inference for protein signaling networksを読みます。松本@理研
nakaneko143
nakaneko143 - (2017/07/13 (木) 13:10)
HopLand: single-cell pseudotime recovery using continuous Hopfield network-based modeling of Waddington’s epigenetic landscape を読みます 芳村@理研
qm_network
qm_network - (2017/07/13 (木) 13:12)
Orthologous Matrix (OMA) algorithm 2.0: more robust to asymmetric evolutionary rates and more scalable hierarchical orthologous group inferenceを読みます 松井@東大
ohmiya_adenocarcinoma
ohmiya_adenocarcinoma - (2017/07/13 (木) 13:22)
A new method to study the change of miRNA–mRNA interactions due to environmental exposuresを読みます
antiplastics
antiplastics - (2017/07/13 (木) 13:33)
Identification of associations between genotypes and longitudinal phenotypes via temporally-constrained group sparse canonical correlation analysisを担当します 露崎@理研
Y-h. Taguchi
Y-h. Taguchi - (2017/07/13 (木) 13:55)
発表者は必ず参加登録してくださいって書かないとおかしなことになりませんかね?ちょっと心配です。
yuifu
yuifu - (2017/07/13 (木) 14:03)
発表希望の方は必ず参加登録をお願いします(と強調しました)
Y-h. Taguchi
Y-h. Taguchi - (2017/07/13 (木) 14:04)
Rectified factor networks for biclustering of omics dataを読みます。 田口@中大 (さっき書いたのはconference paperじゃなかったので訂正します)
Y-h. Taguchi
Y-h. Taguchi - (2017/07/13 (木) 14:05)
すみません、かいてあったのですね>「発表希望者は登録してください」
失礼しました。
yuifu
yuifu - (2017/07/13 (木) 14:18)
Denoising genome-wide histone ChIP-seq with convolutional neural networks を読みます
Ken Kuroki
Ken Kuroki - (2017/07/13 (木) 14:34)
Discovery and genotyping of novel sequence insertions in many sequenced individualsを読みます。黒木@東大
shu65
shu65 - (2017/07/14 (金) 09:13)
Improving the performance of minimizers and winnowing schemes 鈴木@PFN
bicycle1885
bicycle1885 - (2017/07/14 (金) 13:27)
Improved data-driven likelihood factorizations for transcript abundance estimationを紹介します。佐藤@東大
iyak
iyak - (2017/07/21 (金) 02:04)
Genomes as documents of evolutionary history: a probabilistic macrosynteny model for the reconstruction of ancestral genomes を読ませていただきます。よろしくお願いいたします。三宅@東大
Yutaka Saito
Yutaka Saito - (2017/07/24 (月) 13:50)
miniMDS: 3D structural inference from high-resolution Hi-C dataを読みます。齋藤@産総研
Kei Yura
Kei Yura - (2017/07/28 (金) 19:36)
CATS (Coordinates of Atoms by Taylor Series): protein design with backbone flexibility in all locally feasible directions を読みます。由良@お茶大
Tarrrrra
Tarrrrra - (2017/08/07 (月) 14:15)
When loss-of-function is loss of function:
assessing mutational signatures and impact of
loss-of-function genetic variantsを読みます。多良@東大
sesejun
sesejun - (2017/08/08 (火) 19:45)
Chromatin accessibility prediction via convolutional long short-term memory networks with k-mer embedding 読みます。SESE@AIST
Tyu_Shi
Tyu_Shi - (2017/08/10 (木) 17:30)
Abundance estimation and differential testing on strain level in metagenomics data を読みます。森@NIG
kajivalley
kajivalley - (2017/08/10 (木) 19:53)
deBGR: an efficient and near-exact representation of the weighted de Bruijn graph を読みます。梶谷@東工大
stkng
stkng - (2017/08/11 (金) 22:25)
森さん、ありがとうございます。管理者権限でスパムコメントを削除しました。
tiisaishima
tiisaishima - (2017/08/15 (火) 09:35)
Estimation of time-varying growth, uptake and excretion rates from dynamic metabolomics data をよみます 小嶋@東大
nakaneko143
nakaneko143 - (2017/08/18 (金) 10:00)
当日急用のため出席できなくなりました。
以下の発表についてキャンセル致します。大変申し訳ありません。
芳村@理研

>HopLand: single-cell pseudotime recovery using continuous Hopfield network-based modeling of Waddington’s epigenetic landscape を読みます

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