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ISMB2014読み会

日時 :
2014/09/11 (木) 13:00 ~ 18:00
会場 :
ゲノム情報研究センター(CBRC)8階コラボルーム(東京都江東区青海2-4-7)
URL :
http://www.cbrc.jp/ja/map.ja.html
主催者 :

概要

慶大(CBRC協力研究員)の佐藤先生の呼びかけにより「ISMB2014読み会」が行われます。

ISMBは、バイオインフォマティクスの国際学会であるISCBの年会です。
今年は37報のProceedings論文が出ています。
ISMB 2014 PROCEEDINGS

14/09/01 発表者が確定しました。

CBRC外部の方へ

入館証が必要となります。

事前に氏名と所属を連絡くださった方:1 階の受付にて入館証を受け取ってください。
連絡されていない方:1 階の受付にて書類に記入後、入館証を受け取ってください。

発表者の方へ

論文1本当たり20分程度で紹介していただく予定です。

聴講希望の方へ

聞くだけの方も歓迎です。どうぞご参加ください。

タイムテーブル

13:00-13:20 佐藤@慶大
Deep learning of the tissue-regulated splicing code

13:20-13:40 森@東大
Cross-study validation for the assessment of prediction algorithms

13:40-14:00 福永@東大
Automated detection and tracking of many cells by using 4D live-cell
imaging data

14:00-14:20 休憩

14:20-14:40 齋藤@CBRC
A statistical approach for inferring the 3D structure of the genome

14:40-15:00 松本@東大
Methods for time series analysis of RNA-seq data with application to
human Th17 cell differentiation

15:00-15:20 露崎@理科大
RNA-Skim: a rapid method for RNA-Seq quantification at transcript level

15:20-15:40 休憩

15:40-16:00 尾崎@東大
Ragout—a reference-assisted assembly tool for bacterial genomes

16:00-16:20 大宮@理研
Functional association networks as priors for gene regulatory network inference

16:20-16:40 小寺@東工大
Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multi-step
metabolic pathways with a recursive supervised approach

16:40-17:00 休憩

17:00-17:20 樋口@東京医科歯科
GRASP: analysis of genotype–phenotype results from 1390 genome-wide
association studies and corresponding open access database

17:20-17:40 岩切@東大
Tertiary structure-based prediction of conformational B-cell epitopes
through B factors

17:40-18:00 河口@東大
Pareto-optimal phylogenetic tree reconciliation

懇親会

終了後に有志で懇親会を開催する予定です。予約の都合上、大まかに人数を把握しておきたいので、参加を希望される方は9月7日までにご連絡ください。

世話人

佐藤健吾、齋藤裕、尾崎遼、福永津嵩

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stkng
stkng - (2014/07/22 (火) 12:29)
Deep learning of the tissue-regulated splicing codeを読みます。佐藤@慶大
pyoko_pon
pyoko_pon - (2014/07/22 (火) 13:15)
Cross-study validation for the assessment of prediction algorithmsを読みます。森遼太@東大D2
fukunagaTsu
fukunagaTsu - (2014/07/22 (火) 13:18)
Automated detection and tracking of many cells by using 4D live-cell imaging dataを読みます。福永@東大D2
Yutaka Saito
Yutaka Saito - (2014/07/22 (火) 14:29)
A statistical approach for inferring the 3D structure of the genomeを読みます。齋藤@CBRC
gggtta
gggtta - (2014/07/22 (火) 16:54)
Methods for time series analysis of RNA-seq data with application to human Th17 cell differentiation 松本@東大D2
antiplastics
antiplastics - (2014/07/22 (火) 19:20)
RNA-Skim: a rapid method for RNA-Seq quantification at transcript levelを読みます 露崎@理科大
yuifu
yuifu - (2014/07/22 (火) 19:55)
Ragout—a reference-assisted assembly tool for bacterial genomes を読みます。尾崎@東大D3
ohmiya
ohmiya - (2014/07/24 (木) 13:13)
Functional association networks as priors for gene regulatory network inferenceを読みます。大宮@理研
Mas Kot
Mas Kot - (2014/07/25 (金) 09:48)
私自身が著者ですが、もしよろしければ Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multi-step metabolic pathways with a recursive supervised approach. を紹介させていただいてよろしいでしょうか? 小寺@東工大
stkng
stkng - (2014/07/25 (金) 22:26)
↑小寺さん、ありがとうございます。是非お願いします!
HIGUCHI, Chihiro
HIGUCHI, Chihiro - (2014/07/28 (月) 07:27)
もしオープンアクセスでなくてもよければGRASP: analysis of genotype–phenotype results from 1390 genome-wide association studies and corresponding open access databaseを、そうでなければDrugComboRanker: drug combination discovery based on target network analysisに挑戦させて頂ければと思います。樋口@東京医科歯科
stkng
stkng - (2014/07/28 (月) 14:51)
↑樋口さん、オープンアクセスでなくてもとくに問題ないと思います。
iwajun
iwajun - (2014/07/28 (月) 16:08)
Tertiary structure-based prediction of conformational B-cell epitopes through B factors 岩切@東大
HIGUCHI, Chihiro
HIGUCHI, Chihiro - (2014/07/29 (火) 12:28)
コメントありがとうございました。それでは、GRASP: analysis of genotype–phenotype results from 1390 genome-wide association studies and corresponding open access databaseを読ませて頂きます。樋口@東京医科歯科大
ぷ...
ぷ... - (2014/08/19 (火) 20:25)
遅ればせながらPareto-optimal phylogenetic tree reconciliationを読ませていただこうと思います。よろしくお願いします。かわぐち
iwasakiw
iwasakiw - (2014/09/07 (日) 11:15)
予定がつきそうなので、聴講だけで恐縮ですが参加できればと思います(懇親会も)。よろしくお願いします。

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